Desde então as atividades de pesquisa, ensino e difusão do patrimônio arqueológico foram intensificadas no MA resultando na estruturação do Laboratório de Arqueologia e nas Reservas Técnicas de Arqueologia I ( Salas Judite Ivanir Breda) e II ( Sala Margarida Andreatta), que abrigam um acervo de aproximadamente 200 mil peças arqueológicas provenientes de 477 sítios dos Estados de Goiás, Mato Grosso, Tocantins e Rio de Janeiro. Esse patrimônio abarca sítios de diferentes culturas arqueológicas — relacionadas a grupos indígenas dos troncos linguísticos Tupi e Jê-Bororo, por exemplo — com datações radiocarbônicas que recuam ao início do Holoceno. Nesse sentido, as coleções arqueológicas registram histórias dos ameríndios que estão na região muito antes da chegada dos europeus e também de grupos afro-brasileiros e imigrantes que participaram dos processos de ocupação durante o período colonial, atravessando um espectro de mais de 10.000 anos!